早期福建泉漳一帶每當瘟疫流行，沿海居民便建造王船，船上供奉瘟王爺，祭祀後放入大海任其漂流，表示送走瘟疫。王船泊靠之處，被視為王爺巡行之處，當地居民要建醮祭拜，再擇吉日送王爺出海。而泉漳一帶送出的王船大都會順流漂至台灣西南海岸。適逢來台開墾的泉漳移民苦於瘟疫，見到家鄉飄來的王船，便建廟奉祀，祈求消災解厄。奉祀後風調雨順、五穀豐收，於是香火日盛，各地王爺廟越眾。台南喜樹路上的萬皇宮王爺廟則每逢龍年的農曆10月上旬都會舉行盛大的王醮大典，恭送王船遊天河。並出巡遶境鄉鎮3-4天。