現在的竹南中港慈裕宮整建於清道光18年(1838年)，主祀媽祖為黑面三媽，可謂「醫生媽」。清同治13年(西元1874年)因皇上龍體欠安與慈禧太后微恙，乃派臺灣掛印總兵官武隆阿來此求取藥簽，病才治癒，後特獻立「允王唯後」匾額，並每年於農曆7月17日晚上放水燈，18日舉行普渡儀式，邀宴水界各路好兄弟。