早期嘉義因林業興盛而有木材城市的稱號，日治時期為伐木林業而興建從嘉義火車站到阿里山的鐵道公路，博物館現址在當時為存放木料的倉庫用地。館內介紹日治時期興建阿里山鐵道的歷史沿革、阿里山神木外觀的變化、發展阿里山鐵道後的影響。並展示檜木工藝、木器藝術、天然沈香、精油沐浴乳系列商品與檜木文創文具禮品