目前館藏文物多來自於二十世紀初淅川、洛陽、三門峽、輝縣、新鄭、安陽等地的考古發掘，數量達13萬多件，史前文物、商周青銅器、歷代陶瓷器、玉器最具特色。其中國家一級文物與國家二級文物5000餘件，歷史文化藝術價值極高。當時公論曾有言，當世中國之博物館，以藏品而言，除故宮博物院外，河南博物館當屬第二。一部分藏品被譽為國之重器。抗日戰爭期間，河南博物院的部分珍貴文物幾經輾轉最終被珍藏在臺灣國立歷史博物館。