展示館乃結合環保綠建築、輕觸地球的理念，以尊重自然生態為原則，以鋼構高架的方式在漁塭濕地之上，既能維護原有地貌，也可兼具生態和景觀意義，達到環保節能的需求。館內規劃有別於傳統對外封閉的空間設計，採用線性的空間型態，圍繞一處戶外中庭(水池)，更能有效與展示主題的陳設做結合。館內可見到珍貴的黑面琵鷺標本，觀賞黑面琵鷺與濕地生態保育相關影片，接觸多元的生態保育主題，矗立觀景平台，遠眺七股濕地美景，遊覽周邊景點如紅樹林區、鹽山、將軍漁港、南鯤鯓代天府、井仔腳鹽田等風光。