1822年（道光二年）竣工，由兩座廟所組成，大廟代天府；小廟為萬善堂，是全台規模最大、最古老的王爺廟。古蹟本體為一座九開間三進兩廂的建築，由三川殿、正殿及後殿組成，正中央是代天府，左右分置城隍衙、中軍府。外檐裝修的主要材質為石材，花崗石和青斗石間雜，技法上是凹凸雕並用，風格上保有許多泉州建築特色，如山牆的金形鵝頭墜、紅磚底塑白灰與剪黏的山花。樑柱畫作或雕刻作品大部分以現代名人或對國家、當地有貢獻者為主要彩繪對象。除了古蹟本體，還包含萬善走廊、凌霄寶殿、大鯤園與山門等。山門為五門式木作牌樓，共用12根14公尺高的台灣檜木為支柱，屋頂則以重檐設計。凌霄寶殿內以黃金打造的純金玉旨，高6.6公尺、寬2公尺、厚60公分，造價高達新臺幣6億元，堪稱全球最壯觀的黃金玉旨。大鯤園的假山、流水、池塘和涼亭，深具中國江南古典風情，裡面設有「南鯤鯓文史館」，典藏豐富的王爺信仰、歷史沿革等文史資料。